La ECRMM tuvo sus inicios en 1989 con la instalación del radar Perfilador de Vientos como parte de una cadena de radares transpacífica para el estudio de la dinámica atmosférica ecuatorial relacionado al fenómeno El Niño. Desde 2019 tiene dicha denominación y cuenta con infraestructura y equipos para la observación y registro de variaciones en el medio geofísico regional, generando datos útiles para investigaciones de fenómenos naturales con potencial de afectar a la población y a las actividades productivas de la región.