Francisco González Gamarra, además de pintor, fue compositor de obras para piano, orquesta y coro. Nació en Cuzco y, por ello, varias de sus obras están inspiradas en su ciudad natal, como la suite coral Ccoscco y los poemas musicales titulados Macchu Picchu.

Del mismo modo, compuso piezas basadas en la cultura incaica, como Chukillantu, inspirada en una leyenda del folclore andino; Himno al Sol, El canto de las Ñustas y la serie de aires musicales para piano llamada Paisajes musicales.

Su admiración por el Inca Garcilaso de la Vega no solo se reflejó en su obra pictórica, sino también en su música, como en la composición Homenaje a Garcilaso Inca de la Vega, una partitura para piano premiada en Cuzco durante las celebraciones del IV Centenario del nacimiento del cronista. También mostró admiración por Túpac Amaru, a quien dedicó una suite para coro y orquesta que lleva su nombre.

El compositor romántico Frédéric Chopin fue una de sus referencias, lo que se evidencia en sus cinco Suites chopinianas y varios Nocturnos.

Por otro lado, compuso marineras, valses y huaynos, y escribió obras corales tanto en español como en quechua.

Fue un compositor dedicado, como lo demuestra la gran cantidad y variedad de manuscritos que dejó: algunos completos, otros inacabados o con anotaciones. Supo integrar sus dos pasiones, ya que diseñó personalmente las carátulas de algunas de sus partituras, como las de Paisajes musicales y Nocturno.