Su línea de investigación es aplicada y focalizada en el área Migración y Dinámicas socioespaciales y Transformaciones urbano-territoriales. Su trabajo de investigación en el tema Camino Inca en Tarapacá ha sido reconocido durante el año 2019 por el Colegio de Arquitectos de Chile.

Forma parte del grupo fundador de la Red Paisajes de los Desiertos, cuyo objetivo es el desarrollo de proyectos de investigación, divulgación y docencia universitaria, de manera transdisciplinar, atendiendo la condición territorial y paisajística en el ámbito de los desiertos de América.

Trabajó 11 años con la Agencia Española de Cooperación Internacional para el Desarrollo y el Instituto Cervantes, en promoción y capacitación sobre cine documental, especialmente en fomento de la interculturalidad y la investigación rigurosa.
En los últimos 10 años ha formado parte del equipo docente la Carrera de Arquitectura de la Universidad de Los Lagos (Chile), donde se ha dedicado esencialmente a impartir clases de Investigación. Ha podido compartir la reflexión sistemática sobre este trabajo y sus resultados en numerosos eventos internacionales, como el 17º Seminario de Arquitectura Latinoamericana (2018, Ecuador).

Sus líneas de trabajo son: la investigación para la creación audiovisual, la arquitectura, el urbanismo y el paisaje; la educación intercultural; y la gestión artística y cultural. Por ello formo parte de las siguientes organizaciones académicas y profesionales: Asociación ProDocumentales Cine y TV (España, desde 2002), Red Interuniversitaria de Educación e Interculturalidad (RIEDI, Chile, desde 2013), Asociación Internacional de Interculturalidad, Inclusión e Innovación Pedagógica (Brasil y otros 9 países, desde 2018) y la Red de los Paisaje de los Desiertos (Chile-Perú-México, desde 2020).

Ha trabajado en estudios de arquitectura en Londres, Lagos, Nigeria, España y Nueva York. Es director de investigación en el Desert Archive de la Negev School of Architecture, Israel. Su investigación se centra en historia de la arquitectura en el desierto en los periodos coloniales y post-coloniales en el Negev, el Sahara y el Mojave.

Desde el 2009 ha colaborado en ÁMBITOS, Arquitectura y Arte, en el desarrollo de proyectos arquitectónicos y de paisaje. Su línea de investigación se centra en el Paisaje, su evolución conceptual, el estudio de su transformación y su turistificación.

Forma parte del equipo de investigadores de la Red Paisajes de los Desiertos desde noviembre del 2020, que tiene por objetivo el desarrollo de proyectos de investigación, divulgación y enseñanza académica, de manera transdisciplinar, atendiendo la condición territorial y paisajística en el ámbito de los desiertos de América.

El trabajo de Bermúdez se enfoca en la relación entre arquitectura, cultura, y espiritualidad desde la fenomenlogía y neurociencia, temas sobre los cuales ha dado conferencias, dirigido simposios, y publicado en los Estados Unidos y el exterior. Sus proyectos actuales incluyen dos estudios neurofenomelógicos del impacto cognitivo-estético de arquitecturas sagradas y seculares (finaciado por el Templeton Religion Trust) y la finalización del libro ”Spirituality in Architectural Education.” Bermúdez ha publicado otros dos libros: ”Transcending Architecture. Contemporary Views on Sacred Space” (CUA Press, 2015) y ”Architecture, Culture, and Spirituality” (Ashgate, 2015)

El Dr. Bermúdez ha recibido reconocimientos nacionales e internacionales como por ejemplo el Premio de Honor en Educación 1998 otorgado por el AIA (The American Institute of Architecture), el Premio de Realización Creativa 2004-05 dado por la ACSA (Association of Collegiate Schools of Architecture), el Premio a la Trayectoria Creativa Arturo Montagu 2005 ofrecido por SIGraDi (Latino América), el Premio a la Exelencia Docente 2006 otorgado por ACADIA (Association for the Computer-Aided Design In Architecture), el Premio Sasada 2010 por el impacto significativo de su investigación y servicio en el ámbito internacional (dado por CAADRIA, Asia), y el galardón de Profesor Distinguido entregado por la ACSA en 2021.  Bermúdez co-fundó el Architecture, Culture and Spirituality Forum en 2007, un grupo internacional de 700 miembros de 64 países, al que sirve como presidente desde 2015.

Su línea de investigación es aplicada y la focaliza en el área Paisaje Cultural, desde la perspectiva que este otorga como recurso para el desarrollo local. Es profesora en tiempo parcial de la Escuela de Arquitectura de la Facultad de Ingeniería y Arquitectura de la Universidad Arturo Prat, ciudad de Iquique, Región de Tarapacá.

Forma parte del grupo fundador de la Red Paisajes de los Desiertos, cuyo objetivo es el desarrollo de proyectos de investigación, divulgación y enseñanza académica, de manera transdisciplinar, atendiendo la condición territorial y paisajística en el ámbito de los desiertos de América.

Actualmente preside la Red Paisajes de los Desiertos. Es miembro del Comité Científico Internacional de Paisajes Culturales, ISCCL, y de la Federación Internacional de Arquitectos Paisajistas, IFLA; ambos son organismos UNESCO, que congregan la participación activa de los cinco continentes, en torno a la investigación científica aplicada del Paisaje para su protección, conservación y desarrollo sostenible.

Es también profesor visitante en la Architectural Association de Londres y Princeton- Mellon Fellow 2015–2016 en la Universidad de Princeton. En 2014, su pabellón Monolith Controversies, co-curado con Hugo Palmarola, obtuvo el León de Plata en la 14a Bienal de Arquitectura de Venecia. Ambos han realizado exposiciones en The Architectural Association (Londres), Centro Cultural Sao Paulo, LIGA Espacio de Arquitectura (Ciudad de México), Tensta Konsthall (Estocolmo), y son autores de los libros Panel (Architectural Association, 2014), y Monolith Controversies (Hatje Cantz, 2014).

Alonso es también autor de los libros: Space Race Archaeologies: Photography, Biographies, and Design (DOM Publishers, 2016), Acronym (ARQ, 2016), y Deserta: Ecología e Industria en el Desierto de Atacama (ARQ, 2012). En 2019 Alonso fue arquitecto residente en la Fundación Rockefeller en Bellagio, Italia, y curó la exposición Flying Panels: How Concrete Panels Changed the World en el Centro Sueco de Arquitectura y Diseño – ArkDes (2019-2020).